La biopsia líquida se ha consolidado en los últimos años como una de las herramientas más prometedoras para el diagnóstico y la monitorización del cáncer. Frente a las biopsia de tejidos tradicionales, este enfoque mínimamente invasivo permite analizar el ADN tumoral circulante (ADNct) a partir de una simple muestra de sangre, ofreciendo información genética clave del tumor de forma más rápida y segura para el paciente.
Sin embargo, las tecnologías disponibles hasta ahora han tenido dificultades para combinar tres requisitos esenciales para la práctica clínica: alta sensibilidad, amplia cobertura genética y flujos de trabajo sencillos.
Un estudio publicado en The Journal of Molecular Diagnostics describe ahora un nuevo método, denominado Bridge Capture, que podría superar estas limitaciones y facilitar el uso rutinario de la biopsia líquida en hospitales y laboratorios clínicos. La investigación ha sido desarrollada por un equipo de Genomill Health, la Universidad de Turku y el Hospital Universitario TYKS Turku, en Finlandia.
Un equilibrio pendiente en la biopsia líquida
En la práctica clínica actual, las pruebas de biopsia líquida suelen obligar a elegir entre sensibilidad y amplitud. Algunos ensayos son muy rápidos y capaces de detectar mutaciones muy raras, pero se limitan a un número reducido de variantes y requieren información previa obtenida mediante una biopsia de tejido. Otros, en cambio, permiten analizar un mayor número de genes, pero implican procedimientos complejos, largos tiempos de respuesta y costes elevados.
Bridge Capture nace para resolver este dilema, ofreciendo un método de secuenciación dirigida que combina sensibilidad elevada, escalabilidad y un flujo de trabajo simplificado.
De forma resumida, Bridge Capture utiliza un sistema de sondas diseñadas para reconocer regiones concretas del genoma tumoral. Estas sondas capturan las mutaciones de interés y generan estructuras circulares de ADN que pueden amplificarse de manera muy eficiente antes de la secuenciación genética.
Este diseño permite detectar mutaciones presentes en cantidades muy pequeñas en la sangre del paciente, incluso cuando representan una fracción mínima del ADN analizado. Además, el método es compatible con distintas plataformas de secuenciación de nueva generación (NGS), lo que facilita su adopción en laboratorios con equipamientos diversos.
Comparación de Bridge Capture con métodos ya disponibles
El estudio evaluó el rendimiento de Bridge Capture utilizando muestras artificiales que imitaban el ADNct de pacientes con cáncer colorrectal, y lo comparó con dos tecnologías ampliamente utilizadas: LIQUIDPlex y AmpliSeq.
Los resultados muestran que Bridge Capture ofrece una alta concordancia con ambos métodos, pero destaca por su capacidad para detectar mutaciones a frecuencias mucho más bajas. Mientras que las tecnologías comparadas identificaban variantes a partir de determinados umbrales, Bridge Capture fue capaz de detectar mutaciones presentes en menos del 0,1% del ADN analizado, un nivel clave para el seguimiento precoz de la enfermedad o la detección de recaídas.
Además, el método mantuvo resultados consistentes incluso cuando se redujo de forma significativa la cantidad de datos de secuenciación utilizados, lo que se traduce directamente en menores costes por muestra.
«Gracias al uso eficiente de la capacidad de secuenciación, no es necesario recurrir a lecturas extremadamente profundas para obtener resultados fiables», señaló Anttoni Korkiakoski, especialista sénior en bioinformática y coautor del estudio. «Esto abre la puerta a pruebas de alta sensibilidad incluso en laboratorios con presupuestos limitados».
Reproducible y adaptable a distintos entornos
Otro aspecto clave del estudio fue la evaluación de la reproducibilidad del método. Bridge Capture se probó en distintos laboratorios y con flujos de trabajo tanto manuales como automatizados, obteniendo resultados prácticamente idénticos en todos los casos.
Este punto es especialmente relevante en un contexto en el que las pruebas genéticas están pasando de grandes centros centralizados a laboratorios más pequeños y descentralizados. Un método que sea fácil de implementar, robusto y compatible con equipos de bajo o medio rendimiento permite acercar la biopsia líquida al entorno clínico habitual.
«El diseño de Bridge Capture responde a la realidad de la secuenciación clínica actual», afirmó Juha-Pekka Pursiheimo, inventor de la tecnología. «Los laboratorios necesitan detectar variantes raras, pero también requieren procesos simples, rápidos y con costes predecibles».
Escalabilidad sin perder rendimiento
El estudio también analizó la capacidad del método para ampliar el número de genes estudiados sin afectar a su rendimiento. Al aumentar el tamaño del panel genético en más de un 300%, los investigadores comprobaron que la uniformidad y la fiabilidad de las sondas se mantenían prácticamente intactas.
Esto significa que Bridge Capture puede adaptarse tanto a paneles pequeños, centrados en mutaciones concretas, como a paneles más amplios que cubran decenas de genes asociados a distintos tipos de cáncer, incluidos los más frecuentes como el colorrectal, el de mama, pulmón, próstata u ovario.
Aunque el estudio se ha realizado principalmente con muestras artificiales, los autores destacan que los resultados apuntan a un alto potencial clínico, respaldado ya por investigaciones posteriores en muestras reales de pacientes. En el futuro, será necesario evaluar su rendimiento en otros tipos de alteraciones genéticas y en distintos contextos clínicos.
En conjunto, Bridge Capture se perfila como una herramienta prometedora para mejorar la detección de mutaciones tumorales, facilitar el seguimiento de la enfermedad y apoyar la toma de decisiones terapéuticas, acercando la biopsia líquida a un uso más amplio, eficiente y sostenible en la práctica clínica diaria.
