Un grup d’investigadors del Centre de Regulació Genòmica (CRG) i la Universitat Pompeu Fabra (UPF) han desenvolupat una nova tecnologia que aporta llum sobre la infecció pel VIH i ofereix el primer retrat de l’expressió del VIH en el genoma humà.
Quan el virus del VIH entra en el genoma de la cèl·lula infectada, una part dels virus s’inactiva, quedant latent, i evita que el sistema immunitari el detecti. Així s’escapen de les teràpies i segueixen sent una amenaça per al pacient, ja que en qualsevol moment, es poden despertar i reiniciar el cicle d’infecció espontàniament. Moltes teràpies i medicaments disponibles avui intenten reactivar VIH latent amb l’esperança d’eliminar els virus latents en la població. Malauradament, cap dels tractaments proposats ha demostrat ser eficaç per curar els pacients infectats.
L’ADN forà es troba silenciat en el genoma humà per la cromatina hoste, que és un complex d’ADN i proteïnes que embolica i condensa l’ADN per formar els cromosomes. Hi ha diversos mecanismes que regulen el silenciament de la cromatina i, ara, un equip d’investigadors dirigit per Guillaume Filion, cap del grup d’Arquitectura del Genoma al CRG, ha desenvolupat una tecnologia orientada a conèixer el paper del silenciament de la cromatina en la resposta del VIH latent als fàrmacs que hi ha disponibles actualment.
Nova tecnologiaTal com es publica a la revista Nature Structural and Molecular Biology, els investigadors han desenvolupat una tecnologia anomenada B-HIVE, que els ha permès cartografiar els fragments de VIH inserits a tot el genoma humà i mesurar-ne els seus nivells d’expressió. “Hem identificat amb un codi de barres una població de virus gràcies a un identificador genètic. Amb aquests ‘codis de barres’, hem estat capaços de relacionar cada virus títol individual amb la seva localització cromosòmica”, explica Filion, autor principal d’aquest estudi. Els ‘codis de barres genètics’ funcionen com els codis de barres en els productes alimentaris dels supermercats: una vegada tenim tots els articles etiquetats, podem identificar cada element amb el seu codi específic. “A més, hem estat capaços de mesurar els seus nivells d’expressió i demostrar que la resposta del VIH a les teràpies de reactivació depèn en part del lloc d’integració en el genoma humà. Per primera vegada, es demostra amb un exemple pràctic la rellevància del context de la cromatina en la lluita contra el VIH”, afirma l’investigador.
Amb l’ús d’aquesta nova tecnologia, els investigadors han pogut demostrar que els diferents fàrmacs per a la reactivació del VIH ho fan en diferents llocs del cromosoma. És a dir, aquests fàrmacs són més selectius del què es pensava.
